Nel 1941 un lituano uccide il suo vicino ebreo, Isaac, durante il massacro del garage Lietukis. Venticinque anni dopo, nella Lituania sovietica, il regista Gediminas Gutauskas torna dagli Stati Uniti con la sceneggiatura di un film che descrive dettagliatamente il massacro del garage Lietukis ed in particolare la storia di Isaac, l’ebreo, che viene ucciso. La sceneggiatura attira le attenzioni del KGB, il quale avvia un’indagine. Perché un regista che si è trasferito negli Stati Uniti ritorna nella Lituania sovietica? Perché la sua sceneggiatura riporta il massacro in modo così accurato, come se lui stesso ne avesse preso parte? Forse conosce qualcuno che ha assistito al massacro? Le conseguenze dell’omicidio tornano, molti anni dopo, a paralizzare la vita e l’amore.  ISAAC è un viaggio nel passato e nel suo mondo, che si sta distruggendo, basato sull’oscuro omicidio del vicino Isaac.